TABLE 4

Anaerobic species detection and quantification by qPCR in subgingival plaque and sputum samplesa

SpeciesSampleqPCR quantification (CFU/ml) in sample from indicated patient
NC 1NC 2NC 3NC 4NC 5CC 1CC 2CC 3CC 4CC 5
Treponema denticolaSubgingival plaque00003.83 · 10400000
Sputum0000000000
Tannerella forsythiaSubgingival plaque005.78 · 1030000000
Sputum0000000000
Porphyromonas gingivalisSubgingival plaque000000006.75 · 1030
Sputum0000000000
Campylobacter rectusSubgingival plaque5.73 · 10508.70 · 10309.38 · 10500000
Sputum4.07 · 1040003.95 · 10300000
Fusobacterium nucleatumSubgingival plaque3.70 · 1064.24 · 1042.38 · 1052.08 · 1045.82 · 1061.25 · 1073.79 · 1057.58 · 1042.77 · 1060
Sputum3.75 · 1054.37 · 10402.66 · 10404.12 · 104001.53 · 1040
Parvimonas micraSubgingival plaque1.41 · 10409.68 · 10305.34 · 1050004.90 · 1050
Sputum3.16 · 103002.14 · 1021.20 · 1020006.45 · 1020
Prevotella intermediaSubgingival plaque1.54 · 10501.92 · 10400009.90 · 1041.64 · 1060
Sputum2.61 · 106000000000
Eikenella corrodensSubgingival plaque4.59 · 1065.35 · 1041.42 · 1049.22 · 1034.37 · 1051.77 · 1065.77 · 104000
Sputum2.07 · 1052.06 · 1045.10 · 1043.81 · 10504.62 · 1041.31 · 105000
Aggregatibacter actinomycetemcomitansSubgingival plaque0000000000
Sputum0000000000
Total floraSubgingival plaque7.13 · 1092.17 · 1087.80 · 1085.48 · 1088.18 · 1092.70 · 1092.80 · 1084.07 · 1094.18 · 1091.71 · 108
Sputum5.20 · 1081.31 · 1084.26 · 1084.90 · 1085.35 · 1081.57 · 1088.45 · 1087.20 · 1079.60 · 1073.93 · 109
  • a NC, patients not colonized by P. aeruginosa; CC, patients chronically colonized by P. aeruginosa.