TABLE 1.

Species identification of fungal isolates studied by the RLB assay

StrainSpecies submitted asSpecies identification by RLB with the following probe:
ITS1ITS2
ATCC 90028 Candida albicans C. albicans C. albicans
CBS 562 C. albicans C. albicans C. albicans
WM01-157 C. albicans C. albicans C. albicans
WM01-158 C. albicans C. albicans C. albicans
WM01-159 C. albicans C. albicans C. albicans
WM01-160 C. albicans C. albicans C. albicans
WM01-161 C. albicans C. albicans C. albicans
WM01-162 C. albicans C. albicans C. albicans
WM01-163 C. albicans C. albicans C. albicans
WM01-217b C. albicans C. albicans C. albicans
WM01-217h C. albicans C. albicans C. albicans
WM01-218 C. albicans C. albicans C. albicans
CBS 7988 Candida dubliniensis C. dubliniensis C. dubliniensis
CBS 7987 C. dubliniensis C. dubliniensis C. dubliniensis
WM02-73 C. dubliniensis C. dubliniensis C. dubliniensis
WM03-78 C. dubliniensis C. dubliniensis C. dubliniensis
WM03-133 C. dubliniensis C. dubliniensis C. dubliniensis
WM03-160 C. dubliniensis C. dubliniensis C. dubliniensis
WM03-66 C. dubliniensis C. dubliniensis C. dubliniensis
WM03-79 C. dubliniensis C. dubliniensis C. dubliniensis
WM03-119 C. dubliniensis C. dubliniensis C. dubliniensis
WM01-54 C. dubliniensis C. dubliniensis C. dubliniensis
ATCC 90030 Candida glabrata C. glabrata C. glabrata
WM02-57 C. glabrata C. glabrata C. glabrata
WM02-174 C. glabrata C. glabrata C. glabrata
CBS 2030 Candida guilliermondii C. guilliermondii C. guilliermondii
CBS 2031 C. guilliermondii C. guilliermondii C. guilliermondii
CBS 5256 C. guilliermondii C. guilliermondii C. guilliermondii
WM02-72 C. guilliermondii C. guilliermondii C. guilliermondii
WM02-91 C. guilliermondii C. guilliermondii C. guilliermondii
WM02-131 C. guilliermondii C. guilliermondii C. guilliermondii
WM02-356 C. guilliermondii C. guilliermondii C. guilliermondii
WM02-374 C. guilliermondii C. guilliermondii C. guilliermondii
WM02-132 C. guilliermondii C. guilliermondii C. guilliermondii
WM02-361 C. guilliermondii C. guilliermondii C. guilliermondii
CBS 5149 Candida haemulonii C. haemulonii + C. norvegensis C. haemulonii + C. norvegensis
WM 889 C. haemulonii C. haemulonii + C. norvegensis C. haemulonii + C. norvegensis
WM 890 C. haemulonii C. haemulonii + C. norvegensis C. haemulonii + C. norvegensis
WM 891 C. haemulonii C. haemulonii + C. norvegensis C. haemulonii + C. norvegensis
CBS 834 Candida kefyr C. kefyr C. kefyr
CBS 712 C. kefyr C. kefyr C. kefyr
ATCC 4135 C. kefyr C. kefyr C. kefyr
WM 927 C. kefyr C. kefyr C. kefyr
ATCC 6258 Candida krusei C. krusei C. krusei
CBS 573 C. krusei C. krusei C. krusei
WM02-8 C. krusei C. krusei C. krusei
WM02-78 C. krusei C. krusei C. krusei
WM03-98 C. krusei C. krusei C. krusei
WM03-108 C. krusei C. krusei C. krusei
WM03-189 C. krusei C. krusei C. krusei
WM03-190 C. krusei C. krusei C. krusei
WM03-204 C. krusei C. krusei C. krusei
WM1057 C. krusei C. krusei C. krusei
WM1044 C. krusei C. krusei C. krusei
AS142 C. krusei C. krusei C. krusei
CBS 5094 Candida lusitaniae C. lusitaniae C. lusitaniae
CBS 5901 C. lusitaniae C. lusitaniae C. lusitaniae
CBS 4413 C. lusitaniae C. lusitaniae C. lusitaniae
CBS 6936 C. lusitaniae C. lusitaniae C. lusitaniae
WM02-92 C. lusitaniae C. lusitaniae C. lusitaniae
WM02-348 C. lusitaniae C. lusitaniae C. lusitaniae
WM02-9 C. lusitaniae C. lusitaniae C. lusitaniae
WM1036 C. lusitaniae C. lusitaniae C. lusitaniae
WM1037 C. lusitaniae C. lusitaniae C. lusitaniae
WM1038 C. lusitaniae C. lusitaniae C. lusitaniae
WM1074 C. lusitaniae C. lusitaniae C. lusitaniae
WM1138 C. lusitaniae C. lusitaniae C. lusitaniae
CBS 6403 Candida norvegensis C. norvegensis C. norvegensis
CBS 6564 C. norvegensis C. norvegensis C. norvegensis
CBS 4239 Candida norvegica C. norvegica C. norvegica
ATCC 22019 Candida parapsilosis C. parapsilosis C. parapsilosis
CBS 8501 C. parapsilosis C. parapsilosis C. parapsilosis
WM02-2 C. parapsilosis C. parapsilosis C. parapsilosis
WM02-61b C. parapsilosis C. parapsilosis C. parapsilosis
WM02-75 C. parapsilosis C. parapsilosis C. parapsilosis
WM02-89 C. parapsilosis C. parapsilosis C. parapsilosis
WM02-95 C. parapsilosis C. parapsilosis C. parapsilosis
WM02-130a C. parapsilosis C. parapsilosis C. parapsilosis
WM02-166 C. parapsilosis C. parapsilosis C. parapsilosis
WM02-177 C. parapsilosis C. parapsilosis C. parapsilosis
WM02-351 C. parapsilosis C. parapsilosis C. parapsilosis
WM2 359 C. parapsilosis C. parapsilosis C. parapsilosis
WM01-201 C. parapsilosis C. parapsilosis C. parapsilosis
WM01-219 C. parapsilosis C. parapsilosis C. parapsilosis
WM01-216 C. parapsilosis C. parapsilosis C. parapsilosis
CBS 605 Candida pelliculosa C. pelliculosa C. pelliculosa
WM 1039 C. pelliculosa C. pelliculosa C. pelliculosa
CBS 94 Candida tropicalis C. tropicalis C. tropicalis
WM01-202 C. tropicalis C. tropicalis C. tropicalis
WM01-203 C. tropicalis C. tropicalis C. tropicalis
WM01-215 C. tropicalis C. tropicalis C. tropicalis
WM02-86 C. tropicalis C. tropicalis C. tropicalis
WM02-87 C. tropicalis C. tropicalis C. tropicalis
WM02-181 C. tropicalis C. tropicalis C. tropicalis
WM02-183 C. tropicalis C. tropicalis C. tropicalis
WM02-355 C. tropicalis C. tropicalis C. tropicalis
WM1045 C. tropicalis C. tropicalis C. tropicalis
CBS 621 Candida utilis C. utilis C. utilis
CBS 1600 C. utilis C. utilis C. utilis
CBS 4024T Candida viswanathii C. viswanathii C. viswanathii
CBS 619 Candida zeylanoides C. zeylanoides C. zeylanoides
ATCC 204305 Aspergillus fumigatus A. fumigatus A. fumigatus
AS41 A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus
AS42 A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus
AS43 A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus
AS44 A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus
AS45 A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus
AS46 A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus
AS48 A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus
AS49 A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus
AS51 A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus
AS52 A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus
AS116 Aspergillus nidulans A. nidulans A. nidulans
AS60 A. nidulans A. nidulans A. nidulans
AS69 A. nidulans A. nidulans A. nidulans
AS128 A. nidulans A. nidulans A. nidulans
AS53 A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus
AS54 A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus
AS56 A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus
AS57 A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus
AS58 A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus
AS59 A. fumigatus A. fumigatus A. fumigatus
ATCC 204304 Aspergillus flavus A. flavus A. flavus
AS119 A. flavus A. flavus A. flavus
AS120 A. flavus A. flavus A. flavus
AS121 A. flavus A. flavus A. flavus
AS123 A. flavus A. flavus A. flavus
AS61 Aspergillus terreus A. terreus A. terreus
AS62 A. terreus A. terreus A. terreus
AS63 A. terreus A. terreus A. terreus
AS64 A. terreus A. terreus A. terreus
AS75 A. terreus A. terreus A. terreus
AS7 Aspergillus niger NSa A. niger
AS31 A. niger NS A. niger
AS32 A. niger A. niger A. niger
AS33 A. niger NS A. niger
AS35 A. niger A. niger A. niger
AS36 A. niger NS A. niger
AS37 A. niger NS A. niger
AS38 A. niger A. niger A. niger
AS39 A. niger NS A. niger
RV 58146 Cryptococcus neoformans var. neoformans C. neoformans complex C. neoformans complex
JG 02 C. neoformans var. neoformans C. neoformans complex C. neoformans complex
RV 58146 C. neoformans var. neoformans C. neoformans complex C. neoformans complex
PR 101 C. neoformans var. neoformans C. neoformans complex C. neoformans complex
CDCR 461 Cryptococcus neoformans var. grubii C. neoformans complex C. neoformans complex
KRIMM 2 C. neoformans var. grubii C. neoformans complex C. neoformans complex
CBS 7816 C. neoformans var. grubii C. neoformans complex C. neoformans complex
WM01-84 C. neoformans var. grubii C. neoformans complex C. neoformans complex
WM01-85 C. neoformans var. grubii C. neoformans complex C. neoformans complex
WM148 C. neoformans var. grubii C. neoformans complex C. neoformans complex
WM179 Cryptococcus gattii C. neoformans complex C. neoformans complex
4A C. gattii C. neoformans complex C. neoformans complex
4B C. gattii C. neoformans complex C. neoformans complex
4C C. gattii C. neoformans complex C. neoformans complex
10A C. gattii C. neoformans complex C. neoformans complex
10B C. gattii C. neoformans complex C. neoformans complex
10B C. gattii C. neoformans complex C. neoformans complex
10C C. gattii C. neoformans complex C. neoformans complex
  • a Abbreviation: NS, hybridized only with fungus-specific probes and no hybridization signal with species-specific probes.